和华人国防军完成运输移民的交易，赎回被俘虏的两万多巴西士兵后，佩得罗二世随即言辞坚决的拒绝了以累西腓白人地主为代表的北部势力的要求，同时加大围剿各地反叛势力，威慑不服从中央政府管辖的各地方势力。

两万余具有作战经验的士兵回归，巴西帝国军力紧张的局面得到很大程度上缓解，加上为了减轻巴拉圭战争造成的不利影响，佩得罗二世决定通过彻底废除奴隶制度，重树自己明君的形象。

1869年三月，佩得罗二世不顾福罗伯特公爵等大贵族的反对，执意下达了废除巴西帝国境内所有奴隶的法令，

法令规定巴西境内的黑人奴隶只要缴纳一笔赎金，就可以从奴隶主那里获得自由。

黑人奴隶赎金的额度换算为白银约为五十两银子，是国防军普通士兵一年的军饷，南里奥格兰公国土地肥沃，粮食价格为中原地区的一半左右，加上国防军中没有克扣士兵军饷的陋习，五十两银子足够华人士兵过上温饱线以上的日子，而五十两银子对于身无分文的黑人奴隶来说，却是个不小的数目，他们需要在法令下达的三四年时间里做工赚取赎金换取自由。

佩得罗二世想要废除奴隶制度酝酿了很久，1850年他就宣布禁止继续从非洲贩卖奴隶进入巴西境内，三月颁布的废奴法令在借鉴沙皇俄国的废除农奴制度的基础上，又做出一些适应巴西当地情况的改变，比如为了照顾白人奴隶主的利益，防止将大部分白人奴隶主逼迫到对立面，法令规定奴隶主可以优先招募原先属于他们的奴隶进行工作，奴隶的工资按照情况可以适当降低，另一方面，除了参军的黑人，普通奴隶身份的黑人在没有缴纳完赎金前依旧保留奴隶身份，奴隶主在这段时期对奴隶依旧拥有支配权……

沙皇俄国的废除农奴法令本身存在巨大的漏洞和缺点，在俄国，大量农奴由于缺乏钱财换取自由，沦为资本家的廉价劳动力，很多农奴的生存环境不仅没有改善，反而变得更加艰难。

俄国天气酷寒，农奴吃苦耐劳，能够忍受艰苦的生活，而生活在热带地区的黑人，因为环境影响，无法长时间有效率的工作，五十两银子的赎金可能成为黑人奴隶难以偿还的费用。

尽管废奴法令做出许多照顾奴隶主利益的规定，注重自身实际利益的白人奴隶主们还是把佩得罗二世的行为当成对他们的背叛，一部分奴隶主公开做出反对废除奴隶的举动，大部分人则在暗中观察，准备根据巴西国内形势变化做出相对应付手段。

废奴法令在白人奴隶主、庄园主的反对声中持续实行，上百股反对废奴的小股叛乱势力被部队镇压，第一批三万人的黑人奴隶进入军队，增加了佩得罗二世的军事实力。

时间在反叛与镇压中过去了五个多月，废奴法令在巴西表面上实行了下来，而佩得罗二世的名声在欧洲和美国再次传播开来，以首次倡导废除奴隶贸易的英国国家为首，欧洲君主们纷纷称赞佩得罗二世是与俄国沙皇亚历山大二世并立的强力改革者，是文明国家的君主典范，位于大陆另一边的美国也称赞佩得罗二世是一位仁慈开明的君主。